全國臺灣研究會下設(shè)三個機(jī)構(gòu)，即：聯(lián)絡(luò)部、研究部、綜合部。
聯(lián)絡(luò)部負(fù)責(zé)本會對外學(xué)術(shù)交流的聯(lián)絡(luò)事宜，包括邀請與安排臺灣與海內(nèi)外學(xué)者專家來訪；組織各種學(xué)術(shù)交流活動；舉辦本會理事會和團(tuán)體會員會議等。
